台北地方法院合议庭漏夜开庭，于11月12日上午7时许作出裁决，认为陈水扁所犯最轻本刑为有期徒刑5年以上重罪，同时有串证之虞，裁定将陈水扁羁押禁见。陈水扁随即被送进台北看守所，成为首位被收押的卸任当局领导人。

《联合报》当晚进行民调，结果显示，六成民众认为陈水扁被收押是因为贪污事证确凿，仅一成一认为是司法迫害。

进一步分析显示，泛绿支持者对于扁入狱的情绪恚杂，虽有三成四相信扁被收押是司法迫害，但同样有三成四认为是涉及贪污所致，三成无法判断，看法相当分歧；相对来说，泛蓝支持者与中立民众，则是多数认为扁涉贪是收押主因。

至于法院对扁收押的裁定是否恰当，五成九认理由充分，一成六认无此必要，另有二成四的人无意见。交叉分析发现，泛绿支持者虽有五成五认为法院不该收押扁，但也有二成七觉得有此必要，一成八无意见。

针对“检方应否礼遇‘卸任总统’，不强迫扁戴手铐”的争议，调查发现，五成二民众认为检方为陈前“总统”铐上手铐并无不当，二成八主张给予卸任“元首”礼遇，一成九无意见。

至于陈水扁指控遭法警殴打的插曲，六成三不相信扁的说法，仅百分之八相信法警打人，二成九无意见。

这次调查于11月12日晚间进行，成功访问831位成年人，另有276人拒访；在95％的信心水准下，抽样误差在正负三点四个百分点内。调查是以台湾地区住宅电话为母体作尾数两位随机抽样。

另据TVBS民调中心的抽样调查，六成三的民众表示不相信陈水扁是清白，只有一成三的民众相信陈水扁清白没有贪污。

据报道，陈水扁12日遭到收押，2630就成了他的代号。从万人之上的“总统”变成代号2630的阶下囚，现在只要听到主管喊这个号码，曾经权倾一时的陈水扁也只能乖乖地答“有”。

报道称，身陷牢狱的陈水扁不再是西装革履，在舍房内只能换上所方提供的囚衣，加上一双蓝白拖鞋，就连想抹上发油造型一下也不行。

陈水扁12日在台北看守所度过牢里的第一天，经历11个小时熬夜庭讯，阿扁疑似身心煎熬，一入房后倒头就睡，但是又翻来覆去将近半个小时才睡拝。半梦半醒之间的陈水扁，也可能是因为不习惯所内的称呼，还一度错过中午12点的午间点名，管理员叫了两次2630，阿扁才赶紧答“有”。看到午餐也没胃口，只喝了点水就倒头继续睡，一直睡到下午4点半左右才醒过来。

陈水扁的律师郑文龙13日上午到台北看守所探视陈水扁时，原本选3本书给陈水扁在羁押房内阅读。不过，他另受陈水扁夫人吴淑珍托付，带给陈水扁《圣经》、《台湾独立运动》和《被出卖的台湾》3本书，因为当天转送书籍额度已满，郑文龙的3本书最后还是未能送入。

所方则表示，陈水扁睡眠作息一切正常，多以阅读案件的卷宗和其妻送来的书籍打发时间。