国务机要费案中，被告吴淑珍因为不服遭到限制出境，向高等法院提出抗告。高院7月2日下午做出裁定，提告驳回。合议庭认为，吴淑珍16次以生病为理由请假未出庭，却在今年立委以及总统选举期间两度出外投票，再加上案件敏感，裁定吴淑珍有逃亡之虞，理由不变，驳回吴淑珍的抗告。

　　陈水扁妻子吴淑珍因涉嫌贪污国务机要费案，日前遭台北地院裁定限制出境、出海，她不服此一裁定，因而提起抗告。台湾高等法院审酌后，7月2日日驳回其抗告，吴淑珍仍不得出国。

　　台北地院于520新任总统上任后，对吴淑珍作出限制出境、出海的处分，原裁定认为吴淑珍所犯为７年以上的重罪，为确保刑罚权的实现，以及未来审判的顺利进行，因此予以限制出境、出海。高院驳回吴淑珍抗告的理由中，则认同台北地院原裁定的理由，认为原裁定对吴淑珍人身自由的限制，并未逾越必要的程度。而且原裁定并未认定吴淑珍有逃亡之虞，而是以吴淑珍所犯为７年以上重罪为由，才予以限制出境，因此，吴淑珍在抗告理由中，抗辩她并无逃亡之虞，高院认为此一抗辩，没有审酌的必要。

　　由于高院驳回吴淑珍的抗告，因此，在法院解除限制之前，她都无法出国。吴淑珍遭检方以涉嫌贪污国务机要费为由起诉，在法院审理期间，她只出庭一次，并因身体健康理由中途离去，其后，也以健康理由，向法院多次请假未出庭。

　　至于陈水扁，于520交卸总统职务后，最高检察署特侦组于当天分案，将陈水扁列为国务机要费案的贪污共犯，并以出境通知的方式，管制他出境。