国民党对即将合并总统选举的公投案作出决议，将拒领以台湾为名的入联公投票，但并不拒领该党自己推出以“中华民国”为名的返联公投票。

　　虽然国民党官方的态度不拒领“返联公投”票，但该党包括荣誉党主席连战、县市长、中常委以及众多立委都公开支持，拒领包括国民党所提返联公投在内的两项公投案的选票。

　　“理解尊重拒领”

　　国民党主席吴伯雄在该党中常会后宣布说，对于拒领两项公投票者，该党理解并且充分尊重。吴伯雄对拒领“入联公投”票提出的理由是，入联公投引起国际强烈反对，认为是要变更国号，使台湾最重要友邦美国都濒临与台湾翻脸，对台海局势带来不可预测的危险。他说，国民党提的返联公投不会带来台海的危险，也不会伤害台湾与美国友谊，却可以务实弹性，有力表达台湾重返联合国与加入重要国际组织的意愿与决心。

　　国民党总统候选人马英九在回答记者提问时则说，他在选举时将会领取返联公投的选票。

　　民进党批评

　　对于国民党众多人士公开抵制两项公投，但官方态度仅抵制一项公投的作法，民进党质疑，国民党可能是要私下操作拒领公投票，用模糊决议讨好各方。民进党总统候选人谢长廷总部说，国民党应该要光明正大，清楚明白地说明到底要不要领公投票，不应该一方面说要领，实际操作却不领。

　　此前在党主席任内，积极推动入联公投的民进党前主席游杩恳则说，只要是中国反对的，中国国民党也反对，令他怀疑国民党可能是受到中共的压力，甚至是听从中共的命令行事。

　　相对于国民党的拒领入联公投，民进党此前呼吁选民领取两项公投票，并且要选民对国民党所提的返联公投案，也投下赞成票。

　　公投过关机会

　　台湾公投案受到国际瞩目。在国民党再度发动拒领公投票后，若依过去的经验来看，受到国际瞩目的入联公投案，通过的机会可能不大。

　　台湾在2004年总统选举，以及2008年1月的立法院改选，都合并举行公民投票，但这些公投案都在国民党发动拒领公投票下，未获得通过。

　　以2004年总统选举为例，当时提出的“强化台湾国防”以及“与中国对等协商”两项公投案，虽然支持率达九成以上，但因领票率未过半数而未成案。

　　按台湾公投法的规定，公投案要获得通过必须要有一半以上合格选民参与投票，并过半同意才算通过。

　　国民党在上届总统选举时将公投形容为搞文革，并发动拒领；2008年立法院改选时虽推出“反贪腐公投”，但选前则决议拒领民进党的“讨党产公投”，以及该党自己提出的“反贪腐公投”两项公投票。这次却倾向采取一领，一不领的态度。学者认为，这是两害相权取其轻的做法。

　　东海大学政治系研究所教授王业立在受访时说：“返联公投是国民党自己提的，所以在它党内不同势力的意见起争执时，它最终做出了这样的一种妥协。0或1之间的选择，可能会造成更大的损害，采取这种0.5的方式，从他们的观点来看，虽然还是有损害，但损害程度比较少。”王业立也认为，公投议题不致于对选情有太大影响，因为蓝军的支持者大概都能理解国民党党中央目前的处境。