台湾民进党提案“以台湾为名申请加入联合国”的公投案在内部遭到法理正当性的挑战，但陈水扁仍旧笃定宣告“入联公投”将与总统大选一并举行，并透过《华盛顿邮报》向美国当局再度传达坚定立场。

　　6月19日，美国国务院批评民进党的入联公投案不仅无助于台湾加入联合国，反倒升高台海紧张，强烈反对并促请陈水扁拒绝此一倡议。但陈水扁最近接受《华盛顿邮报》访问，态度强硬地重申“入联公投”不违背他提出的“四不”(不宣布独立、不改国号、不推动两国论入宪、不推动改变现状的统独公投)，并表示不知美国反对的原因到底为何。

　　陈水扁反问，入联公投“是反对公投、还是反对参加联合国、还是反对用台湾的名义”。陈水扁透过访问直接指出公投不符合北京利益，所以美方才会反对。过去将公投视为洪水猛兽的国民党，也提出以台湾名义申请联合国的相关公投提案，是台湾社会朝野的共识与进步，颇有为他的倡议进行背书意味。

　　但公投审议委员会驳回民进党提案的入联公投案，中选会已宣布总统大选与明年1月中的立委选战脱钩进行，这项宣布有助于民进党推动公投绑总统大选的救援行动。中选会日前以未达社会共识为由，决议总统大选定在明年3月22日进行，与先前民进党坚持推动的总统合并立委选举背道而驰，遭到泛蓝政党批判是为单一政党服务，有政治考量。