据台湾“中央社”报道，张俊雄6月27日下午表示洪奇昌是海基会董事长唯一人选，海基会28日召开第六届董监事第七次联席会议。洪奇昌27日下午接受访问时表示，感谢张俊雄的肯定，但不清楚人事案是否就定案，他会配合政府政策，现在就谈理念还早。

　　他说，两岸政策由“行政院大陆委员会”与“国家安全”会议制订，海基会是执行并服务台商的单位，主要应让台商茁壮，促使台商再回台湾投资，两者不冲突；希望两岸能有良性互动，海基会也应扮演服务台商，内部协调整合的角色。

　　洪奇昌指出，未来海基会在执行民进党政策时，若能扮演内部沟通协调角色，将可建构双赢局面，也有利于两岸经贸关系，他会尽最大努力配合民进党政府政策，并维护台湾尊严。

　　至于外界分析前新潮流系大老洪奇昌出任海基会董事长，是党内向新系示好，洪奇昌说，不要说这些东西，但此时党内确实需要团结，让民主更深化，作为党的一份子，他愿尽心力。