为了厘清贪污特别费的污名，台北市长马英九在筹组律师团的同时，主动全面清查就任市长期间的公益捐款详情，以供侦办弊案的检调单位参考，并作为日后贪污起诉的法律攻防利器，捐款总金额近7000万元新台币，在11月30日正式公布。

根据台北市政府清查的捐款大致内容，包括马英九两次参与台北市长选举的竞选剩馀经费及补助款分别约230万元与4750万元，就任市长到今年5月汇入银行账户的特别费500多万元，与11月爆发弊案后再捐出的1150万元，粗估约6630多万元。捐款金额超过马英九8年市长任期汇入账户的1570多万元特别费。

马英九公布捐款希望自清，但法律问题仍待检方认定。不过司法实务人士认为，选举补助等经费在法律上属于马英九财产，只要在同一年度捐出，当然可视为特别费的使用，没有侵占问题。