身为台湾总统陈水扁下属却不畏强权、政治色彩深绿却超越个人政治信仰的台湾高等法院检察署查黑中心检察官陈瑞仁，在宣布“国务机要费”侦结，决定以贪污、伪造文书罪名起诉“第一夫人”吴淑珍等人后，赢得海峡两岸舆论和民众的共同敬重。他不但成为不少台湾民众心目中的包青天，还有大陆网民希望大陆法律界人士能以陈瑞仁为榜样。

台湾《壹周刊》在陈瑞仁宣布起诉吴淑珍当天推出的“号外”中，高度赞扬陈瑞仁“终于实现他的座右铭，在这历史的大关卡上，从民众期待的司法英雄，一跃成为名垂青史的历史人物”。红衫军在获知吴淑珍被起诉后，士气大振，重回台北车站呛扁，直呼检察官陈瑞仁是现代包青天。在互联网上，也有台湾网友拿敢于犯颜直谏的唐代贤臣魏徵来形容陈瑞仁，称“在陈水扁还没被起诉定罪前，就指出过失，应该要颁发荣誉勋章给陈瑞仁”。

在中国大陆，福建日报集团旗下的《海峡导报》在题为《陈瑞仁：不惧权势　铁腕查黑》的报道中说：“重任之下也是明显的巨大压力，陈瑞仁要有始有终地侦结起诉、甚至到庭论告，而对象则是‘总统’及身后的整个绿营体系，但陈瑞仁当仁不让地站了出来，不管掌声或嘘声地一路走来，展现出被台湾媒体所说的‘虽千万人吾往矣’的大无畏精神。”也有大陆网民从两岸司法比较的角度，在肯定陈瑞仁的同时，希望大陆法律工作者能向这位铁面无私的台湾同行看齐，以他为表率。