台北市政府宣布疫情趋缓之№，各界开始追究谁该为疫情难以收拾负最大责任。陈水扁5月12日上午重话抨击和平医院涉嫌隐匿疫情，台北市卫生局长邱淑 紧接著宣布免除该院院长吴康文职务，改调为顾问医师；台北地检署也主动追究吴可能触犯的刑责，监察院日前则已展开调查。
市府官员说，由於市长马英九坚持必须待流行病学调查完成之後才能依此追究责任，所以卫生局现无法判定吴康文是刻意隐匿疫情，或缺乏警觉而酿成大灾，更无法做任何行政处分。但吴康文处理不当已导致至少5名和平医院工作人员死亡，以及多人病危；市府宣布将他免职，并不能平息外界的愤怒。
陈水扁在讲话中暗指吴康文涉嫌隐匿疫情，但邱淑 则以完成阶段性任务为由，宣布免除吴康文职务，遗缺由中兴医院院长翁林仲接任。吴康文事先并不知情。他说，他也是看了电视跑马灯才知道这件事，他对这项调职“欣然接受”；但对外界质疑隐匿疫情部分，他则强调不知情。
吴康文被免职後，和平医院医护人员及受感染病患家属，对吴甚觉愤怒。一名护士说，当时院内多人感染，吴康文还不肯停门诊，“都是为了钱，医院一天有500万元的收入，他们不愿少赚这些钱。”“他害死了那堋多人，太便宜他了。”《中华日报》报道称，国泰医院院长陈楷模怒气难消，他说，和平医院死了这堋多人，吴康文是应该要切腹；迄今与和平医院有关的非典通报案例已达二百馀名，而惩处层级止於和平医院院长，陈楷模叹了一口气说，这件事弄得那堋大，社会要有公平，要有正义。
吴康文身为公立医院院长，如在封院前早已明知发生院内感染而坐视不管，故意隐匿疫情，以致於酿成多人因此而死亡之灾害，吴康文已经触犯刑法130条之“公务员废弛职务酿成灾害”罪，将被处三年以上十年以下有期徒刑。
市府官员说，由於市长马英九坚持必须待流行病学调查完成之後才能依此追究责任，所以卫生局现无法判定吴康文是刻意隐匿疫情，或缺乏警觉而酿成大灾，更无法做任何行政处分。但吴康文处理不当已导致至少5名和平医院工作人员死亡，以及多人病危；市府宣布将他免职，并不能平息外界的愤怒。
陈水扁在讲话中暗指吴康文涉嫌隐匿疫情，但邱淑 则以完成阶段性任务为由，宣布免除吴康文职务，遗缺由中兴医院院长翁林仲接任。吴康文事先并不知情。他说，他也是看了电视跑马灯才知道这件事，他对这项调职“欣然接受”；但对外界质疑隐匿疫情部分，他则强调不知情。
吴康文被免职後，和平医院医护人员及受感染病患家属，对吴甚觉愤怒。一名护士说，当时院内多人感染，吴康文还不肯停门诊，“都是为了钱，医院一天有500万元的收入，他们不愿少赚这些钱。”“他害死了那堋多人，太便宜他了。”《中华日报》报道称，国泰医院院长陈楷模怒气难消，他说，和平医院死了这堋多人，吴康文是应该要切腹；迄今与和平医院有关的非典通报案例已达二百馀名，而惩处层级止於和平医院院长，陈楷模叹了一口气说，这件事弄得那堋大，社会要有公平，要有正义。
吴康文身为公立医院院长，如在封院前早已明知发生院内感染而坐视不管，故意隐匿疫情，以致於酿成多人因此而死亡之灾害，吴康文已经触犯刑法130条之“公务员废弛职务酿成灾害”罪，将被处三年以上十年以下有期徒刑。