由於台湾非典疫情恶化，台湾行政院５月13日召开紧急会议，讨论通过新台币500亿元非典防治及纾困特别预算案。当局为因应防治及纾困所 经费，循特别预算程序办理；其中新台币70亿元自筹财源，其馀新台币430亿元得以举借债务支付，不受“公共债务法”举债上限限制。
同时，台湾国防部动员1000名化学兵及700名宪兵，对台北市进行全面大消毒，而第一个锁定的目标就是疫情集中的万华区。台湾化学兵及宪兵分成许多小组在全区36个里进行更细致的消毒工作。许多住户都打开大门，让士兵进入屋内楼梯间，喷洒漂白水。
喷洒的方式主要分成两种，街道用多功能的军用吉普车运载大桶的漂白水，沿路喷洒，路边的汽车、摩托车、路面、水沟、人行道旁的树木等等，都不放过。第二种则是由化学兵和宪兵组成的小队，挨家沿户喷漂白水。
由於和平医院大规模院内感染，造成多人死亡与感染，而感染源更疑往外扩散到万华等社区。台北市卫生局已将和平医院院长吴康文革职，新院长一职由中兴医院院长翁林仲兼任。台北市长马英九表示，撤换吴康文的理由，完全是阶段性的任务导向。吴康文已经完成前一阶段的任务，在身心俱疲之下，不宜再进行下一阶段任务，现在将会由专家进行调查、 清所有人员的行政责任。市府将充分配合检调单位、监察院的调查。
此外，台湾１４日再增23个非典新病例，累计达207人，死亡人数增加4例，达24例，已超越加拿大，在全球仅次於中国大陆、香港、新加坡，死亡率为11.5%，创下新高。
同时，台湾国防部动员1000名化学兵及700名宪兵，对台北市进行全面大消毒，而第一个锁定的目标就是疫情集中的万华区。台湾化学兵及宪兵分成许多小组在全区36个里进行更细致的消毒工作。许多住户都打开大门，让士兵进入屋内楼梯间，喷洒漂白水。
喷洒的方式主要分成两种，街道用多功能的军用吉普车运载大桶的漂白水，沿路喷洒，路边的汽车、摩托车、路面、水沟、人行道旁的树木等等，都不放过。第二种则是由化学兵和宪兵组成的小队，挨家沿户喷漂白水。
由於和平医院大规模院内感染，造成多人死亡与感染，而感染源更疑往外扩散到万华等社区。台北市卫生局已将和平医院院长吴康文革职，新院长一职由中兴医院院长翁林仲兼任。台北市长马英九表示，撤换吴康文的理由，完全是阶段性的任务导向。吴康文已经完成前一阶段的任务，在身心俱疲之下，不宜再进行下一阶段任务，现在将会由专家进行调查、 清所有人员的行政责任。市府将充分配合检调单位、监察院的调查。
此外，台湾１４日再增23个非典新病例，累计达207人，死亡人数增加4例，达24例，已超越加拿大，在全球仅次於中国大陆、香港、新加坡，死亡率为11.5%，创下新高。