台湾总统府虚报公账疑云闹大，自监察院审计部查账证实，2005年度国务机要费总计高达3684万元（新台币），占总支出77%因用途无法说明而移送司法调查。最高检察署初步调查也确认“有违法之嫌”，将约谈总统府会计和出纳主管，追究行政责任乃至刑事罪责。这也是中华民国史上总统府账目移送司法查办首例。
　　这个事件的后续政治效应急速发酵，亲民党已发动弹劾总统案，寻求其他在野党连署，不排除8月中争取召开立法院二次临时会正式提案。不过，国民党因弹劾与罢免同为三分之二高门槛，通过机会不大，仍未表态是否支持。
　　审计部公布总统府“国务机要费”核查结果，2005年度的4786万元总支出中，有2407万元总统府以“机密”为由拒绝提供单据供审查；另1277万元单据不清楚，无法说明用途。另外，从2003年至2005年间，国务机要费核销单据出现5家商号发票，包括五星级君悦饭店、国宾饭店、SOGO、引雅珠宝和聚玉斋珠宝公司发票，疑总统府连续多年以私人消费报销公账。其中，目前旅居澳洲的“台湾红”董事长李慧芬早在6月间揭露，返台住宿君悦的单据全让堂姐李碧君拿去给吴淑珍销账。而在SOGO单据中，有超过1500万元是采购礼券，疑与吴淑珍介入SOGO经营权有关。
　　审计部已将“不合格”的3684万元从决算支出项目中减列，若总统府仍无法提供单据清楚交代，须依法在5年内追缴、还给国库。涉及“不法”部分，移送司法单位厘清是行政违规，或已构成刑事犯罪。如果只属行政违规，由监察院进行行政处分。一旦涉及刑事罪责，公务员不实报账1至7年徒刑，总统府官员虚报国务机要费图利总统或中饱私囊，则属贪污重罪，判刑5年以上徒刑，甚至可判无期徒刑。若总统本人涉案，在任期间除内乱外患罪之外享有刑事豁免权，除非遭罢免或解职，否则不受刑事追诉约束。但检察官仍可依法查办，惟须搁置至总统卸任后才可追诉论罪。
　　国务机要费疑云引爆后，总统府先是回避不回应，而后尝试以“南线机密外交”、“人道援助”等说法为国务费“不明支出”解套。至审计部公布查核结果后，府方首次发表简短书面声明，指国务机要费不过是沿用了国民党执政时代的程序“循例办理”，而今审计部忽然“有不同意见”，府方予以尊重，同意检讨后再交审计部审定。
　　高检已下令查缉黑金行动中心“放手查、积极办”。据媒体引述检调内部消息，初步调查确认君悦饭店发票报销过程“有违法之嫌”，除已密集约谈君悦相关人员，检调决定传召总统府会计室主任冯瑞麟及总统办公室出纳主管陈镇慧到案说明。至于是否也调查陈水扁，检方说：“陈总统也是公务员。”
　　除因国务机要费疑虚报公账受调查，台湾总统府也承认，女儿陈幸妤夫妇家中的私人帮佣阿卿嫂是挂名“总统府工友”，由总统府支付薪水，5年来200万元台币女佣费，由国库和全民“埋单”。由于行为涉及“私仆领公帑”，遭朝野同声批判。执政民进党党中央更罕见地第一时间出面谴责，指党中央对总统府言行“深深不以为然”，吁总统府“注意社会观感谨言慎行”，要求陈幸妤和赵建铭夫妇“自行承担帮佣薪资”，将过去由国库支付的薪资全数归还。这其实已不是“第一家庭”第一次使用政府公款负担家务开支。长期负责照顾吴淑珍、为她推轮椅的罗太太，2年前就遭检举占用国安局特勤中心公务车，还把特勤人员当私仆，并私领国安情报津贴74万元，最后也追缴回国库。
　　深绿台联立委赖幸媛举李登辉女儿李安妮为例说，李登辉当总统时，李家很低调，李安妮坚持自己开车，出门拒绝随扈陪同；当今“第一家庭”公私不分的程度让她震惊。