陈水扁再度面临执政危机，绿军学界7月15日公开呼吁陈水扁辞职，以建立范例，为台湾民主做出贡献。陈水扁度过蓝军罢免危机，却难抵御昔日战友联署要求辞职。
　　长期支持绿营的学者、社会运动者，包括中央研究院研究员吴乃德、美丽岛事件政治受难者张富忠、台大社会系助理教授范云、台大政治系副教授黄长玲、清大社会所副教授吴介民等，发起联署“吁扁辞职”。这群学者在15日召开记者会，正式发表声明。
　　声明表示，在已经失去道德威信和人民信任的时候，我们呼吁陈总统慎重考虑辞去职务，他的辞职，将对台湾政治做出巨大的贡献，对台湾民主发展也将有深远的影响，其价值远超越司法正义所能衡量。不过吴乃德强调，这项行动主要不是为了“倒扁”，而是要提升台湾的民主质量。
　　对于绿营政界的焦虑紊乱，学界选择观望。参与发起连署的专栏作家郭宏治表示，所有经扁幕僚或府方发言人转达的“扁立场”，学者都不视为正式回应，民进党接连发表虚心检讨声明，也不过是形式表态。另一位发起人、中研院助理研究员徐斯俭表明，学界在全代会召开前不会再提任何看法，好给民进党时间沉潜，厘清下一步行动。
　　学界发起的网上“倒扁”连署，已突破2万人。据当局依连署人网络IP所进行的地域统计，连署人以台湾占了多数，却也包括世界各地网民：美国地区的连署人居次，有1241人，占6%；中国大陆连署人889，占4.6%；连新加坡也有32人连署。