针对陈水扁表示考虑废除国统纲领及公投新宪等谈话，中国大陆涉台官员明确表示，北京当局愿尽全力维持两岸和平稳定关系，努力朝这一方向走；但如果陈水扁一定要触犯底线，推动法理台独，北京将以“另一方式”处理台湾问题，“不会手软”。如果陈水扁执意玩“边缘游戏”，北京也会“奉陪到底”。
　　不过，大陆涉台官员同时坦承，陈水扁抛出的这些议题，碰到北京最敏感的神经，使北京陷入“理会”或“不理会”的两难困境。
　　大陆指出，陈水扁说要推动用“台湾”名义加入联合国，这是不可能的事；废国统会及国统纲领，实际上，这些年来，两者已名存实亡。但若与公投新宪法配套，就是进行“法理台独”，等同公开打出台独名号，对北京当局施加压力。北京若无反应，民众会认为中央政府对台湾搞台独坐视不理，无法对人民交代；若有相对反应，则上了陈水扁的当。因为大陆当局反应越激烈，就会使民进党更团结，而这正是陈水扁所期望的。
　　今年元旦过后不久，中共中央举行对台工作会议。会议决定，对台工作仍将以构建两岸和平稳定关系为主轴，推动直航，争取民心，积极落实对台湾民众的承诺；操控两岸关系主动权，不随陈水扁起舞。