对于在1999年东京都日野市立小学的开学典礼上，一名音乐老师违反校长的职务命令，拒绝用钢琴伴奏“君之代”而受到东京都教育委员会警告处分一案，最高法院2月27日宣告，支持东京高等法院做出的认定校长的伴奏命令符合宪法的二审判决，并驳回了原告要求撤销处分的上诉。原告的败诉至此最终确定。

审判长那须弘平在判决理由中指出：“校长的伴奏命令并没有否定原告的历史观及世界观，所以不能说其违反了保护思想及良心自由的宪法第19条。”

在日本，因不服从有关“太阳旗”“君之代”的职务命令而受到处分的学校教师相继提起诉讼，而最高法院对此类案件做出判决尚属首次，预计这将给其他判决带来很大影响。

1999年4月，原告在其当时任职的日野市立小学的开学典礼上拒绝进行伴奏。东京都教委认为其不服从职务命令，违反地方公务员法，因此对其处以了警告处分。

在2003年12月的一审判决中，东京地方法院驳回了原告请求，称“公务员应为全体国民服务。从公共福利的角度来看，公务员自身的思想和良心应该受到制约，因此应服从职务命令，学校的做法和教委的处分决定均符合宪法。”在2004年7月的二审判决中也支持一审认定，因此原告再次上告至最高法院。

“君之代”从日本明治时代起便一直是正式活动时所唱的歌曲，但直到1999年才被日本法律正式追认为国歌。因其容易让人联想起战败以前天皇制度下的军国主义时代，反对之声至今仍不绝于耳。

同时，东京律师联合会2月28日透露，对东京都府中市立小学的一名56岁教师因没有在毕业典礼上合唱“君之代”时起立而受到惩戒处分一事，已向都教委发出了警告。该联合会认为，“东京都教育委员会在听取情况的时候不允许律师在场，没有保障合理的手续，属于违宪行为”。受到处分的教师申请了人权救济。

从这份落款日期为2月28日的警告书获悉，该教师在2005年3月毕业典礼上齐唱“君之代”时没有起立，因而都教委传唤他去说明情况。他要求律师在场，但是遭到了教委的拒绝。教委最后在没有听取事情经过的情况下就对他实施了警告处分。此外，该教师在同年7月参加研修时，穿著印有标语的背心，标语中写道“反对强制推行‘太阳旗’和‘君之代’”，为此，他再度受到警告处分，经过和第一次相同。

对此，都教育厅职员科表示，“（听取情况）仅仅是要确认事实关系，没有允许律师在场的法律依据，也没有这个必要”。