日美两国政府日前决定，将于今年年内在驻日美军嘉手纳基地（位于冲绳县）和嘉手纳弹药库地区部署爱国者导弹(PAC3)，这是美军最先进的地对空诱导导弹。发射架预计为24座，同时还将有约600名美军士兵进驻冲绳县，PAC3导弹在驻日美军基地得到部署尚属首次。
　　7月5月日美安保协议委员会(2+2)总结出的驻日美军整编最终报告曾这样记述爱国者导弹：“美军爱国者导弹的性能将在日本已有的美军设施和地区得到推广，并有望在尽可能早的时期得到运用。”在敌方弹道导弹再次进入大气层但尚未落地时，爱国者弹道可由地面发射加以拦截。有分析认为这一部署有可能是为了应对朝鲜以及中国。朝鲜7月5日试射了7枚弹道导弹。
　　另一方面，防卫厅将于2006年年末到2010年年末对以下部门部署爱国者导弹。它们分别是航空自卫队的6个高射群中守卫首都及周围地区的第一高射群(位于□玉县)、防御近畿·中京地区的第四高射群(位于歧阜县)、防御九州地区的第二高射群(位于福冈县)以及滨松基地(位于静冈县)的教育部队。防卫厅还计划在2011年以后对另外三个高射群推进部署。