吴仪被西方舆论描述为争端调解专家，她曾经成功处理过包括对外贸易争端和公共卫生大混乱在内的各种危机。在中日关系持续冷却的危机时刻，吴仪受命出访日本，责任艰巨，任务重大。日方认为，吴仪本次访日行程，整体气氛良好，以经贸促交流，有利于缓和中日关系的紧张局面。
吴仪参加“中国馆日”
送出2008件北京奥运衫
吴仪本次访日的主要目的是出席5月19日举行的“ 爱知世博会．中国馆日”活动。在日本国际贸易促进协会会长、前首相桥本龙太郎、爱知世博会会长丰田章一郎、日本经济产业大臣中川昭一等陪同下，吴仪于19日下午来到中国馆，受到热烈欢迎。
去年在西安发现的日本遣唐使井真成的墓碑和墓志铭在中国馆显要位置展出。馆内巨大的“生命树”造型既体现“自我的智慧”，更象征中华民族的旺盛生命力。“生命树”上挂着五颜六色的祈愿彩带，日本观众纷纷写下“世界和平”、“日中友好”的话语。桥本龙太郎也取下一条白色祈愿带，写下了“以和为贵”。吴仪从桥本手中接过祈愿带，亲手挂在“生命树”上。此前一天，国土交通大臣北侧一雄参观中国馆时，也在留言簿上写下了“友好”两字。
北京市在“中国馆日”举办了向日本观众赠送8888件北京奥运T恤衫活动。北京市副市长陆昊邀请吴仪亲自把第2008件北京奥运衫赠送给日本观众。来自东京的伊藤晴美幸运地接受了这件T恤衫，她将成为2008年北京奥运会的幸运观众。吴仪紧握伊藤的手，向她表示祝贺，并邀请桥本、丰田、中川等人士一起与幸运观众合影留念。
来自北京和上海的精彩文艺演出为“中国馆日”增添色彩。由聋哑人等演出的“千手观音”经典节目受到日本观众欢迎。在中国馆之后，吴仪还兴致勃勃地参观了蒙古馆、韩国馆、日本馆和丰田馆。
吴仪表示，爱知世博会取名“爱地球”，以“自我的智能”为主题，从设计施工到组织运作，都体现了对地球和大自然的关爱，也体现了日本人民的智慧和创造力。吴仪相信日本举办世博会的先进理念和经验对中国办好世博会将起到借鉴作用，她热情邀请各国朋友光临2010年上海世博会。吴仪本人现在担任世博会全国组织委员会主任。
吴仪力促中日经济合作
倡导建立产业联盟
吴仪访日，在世博会之外还参加了各项经济交流活动，如“21世纪城市发展论坛”、“东海日中贸易中心成立50周年纪念会”，日经“亚洲未来”论坛等。吴仪访日之行堪称经贸之旅。吴仪在各种场合强调了中日合作以推动共同发展与持续繁荣的重要性。
吴仪在城市论坛上从四个方面阐述了中国政府的城市发展战略。1、坚持可持续发展，建设节约型城市；2、坚持中国特色的城镇化方针，形成大中小城市和小城镇协调发展。3、坚持城乡统筹，城市繁荣带动农村发展。4、坚持以人为本，实现城市经济社会全面发展。
吴仪于5月18日在“东海日贸中心纪念会”上对做好中日经贸合作这篇大文章提出了六点建议：1、尽快启动中日双边自由贸易区进程，与东亚一体化进程和中日韩合作相协调。2、推动能源合作，双方本着平等互利原则，积极推动能源领域的交流与合作。3、促进产业战略对话。双方可在钢铁、造船、精密仪器、IT、软件等重要产业领域加强合作，探索建立某种形式的产业联盟，就产品、结构、产量和发展方向进行战略协调。4、加大技术合作力度。5、加快日本对中国不发达地区的投资步伐。6、开展中小企业合作。
在5月23日上午的日经“亚洲未来”论坛特别演讲中，吴仪指出加强亚洲合作应做好三件事：全面健全并拓展东盟与中日韩的合作框架，加强中日韩三国合作，推进泛亚洲合作。吴仪强调中国政府和人民高度重视中日关系，一向奉行对日本友好政策，愿继续本着“以史为鉴，面向未来”的精神，以三个政治文件为原则基础，与日本人民和平共处，世代友好，互利合作，共同发展。