在尼加拉瓜参加该国总统就职典礼的陈水扁透露，他这次出访过境美国是由美国总统布什亲自决定的，他也重申对美国与布什的承诺绝对不会改变。

陈水扁与媒体茶叙时说，他此行过境美国西岸，因为时间紧凑又遇到圣诞节与新年假期，以及不久前美国前总统福特的国殇大典，因此相关行程直到在1月5日才由布什拍板定案。他说这次出访并不是要用元首外交来修补台美关系，过去半年来台美的互动很好，沟通没有障碍。

陈水扁1月9日在旧金山过境一晚，过境期间，与包括美国前国防部长佩里以及华府的国会领袖通过电话，其中也包括同华盛顿行政部门的高层人士通话。陈水扁说，他与华府高层士谈话是近几年来感觉最好的一次。他感佩美国政府对访问团的欢迎以及对他的肯定，感谢布什、国安会与国务院等部门提供台湾访问团的过境礼遇，同时他也将遵守对美国政府与布什的承诺。

陈水扁在旧金山过境停留一个晚上，从抵达到晚宴结束，共有14项行程安排。他在回程时还将过境洛杉矶，但是停留时间仅有几个小时。