台湾5月10日开始有史以来第一次总统大选的司法验票。这场被视为“总统大选延长赛”的验票第一天就风波不断，朝野双方对于无效票的认定出现争议，各个验票中心也传出选票短少或与选民名册不符的消息。
国民党秘书长林丰正10日晚召开记者会说：冒领、多发选票、灌水的情况比想象中严重；国民党代表律师蔡玉玲指出，验票过程发现的弊端比国亲接到民众检举的还多。按照法律，如果中选会的选务出现重大瑕疵，法院将判决选举无效而重新补选。代表民进党验票的律师顾立雄则在民进党的记者会上表示，从整天的验票看来，他不认为会有多过2万张的争议票，使选举结果翻盘。
验票结果被认为是国民党候选人连战政治生涯的“最后一仗”，他10日到台北县的验票中心向参与工作的律师致意时表示，验票不是为了个人或政党，而是为了台湾的民主法治和公理正义。亲民党主席宋楚瑜说，在野党会据理力争，但不会无理取闹。担任连宋竞选总部主任委员的立法院长王金平表示，验票结果与蓝军是否承认败选没有关联。验票只是第一阶段，随后必须进行选民名册的对比，以及最后阶段的当选无效、选举无效诉讼。
台湾高等法院指出，验票工作只是属于第一阶段的“形式验票”，本次整理出来的争议票，每一张都必须交给高等法院的合议法庭，再由双方律师经过辩论认定，最后才决定验票结果，按照法律，整个过程最迟必须在6个月内结案。台高院合议庭12日傍晚紧急函文传真全台各地方法院，凡是大选票袋全部错放公投票，以及选举人名册错置，必须取出公投票袋，核对是否装有大选选票，和选举人名册，并进行勘验；凡是公投票袋中有部分总统大选选票、部分公投票，则短少的大选选票一律改计无效票。
总统大选司法验票过程中，从台北县市到高屏县市都发现公投票与总统选票错放、公投选举人名册与总统选举人名册错置情况，衍生重大争议。国亲律师因此紧急前往高院递状，申请合议庭裁定，凡是在公投票袋中找到总统选票，应由发现的各地院查扣、封存，然后送交高院合议庭实质调查。由于本届的总统大选首次与公民投票同时举行，验票工作出现不少状况，包括选票失踪、选票数目与选民名册不符、空白选票流失、选票袋封口无端开启等现象。
台湾验票进行到14日，国亲初步统计需送高院认定的争议票已超过3万张，至于选举人名册和选票兜不拢的“幽灵选票”也继续长到接近2万张。验票以来，国亲律师疲于兜拢各种数字。例如，选举人名册缺页不完整，领票数就不完整，选票不见了，领票数和投票数也兜不起来，可能有冒领的问题。在高院判读之前，这些选票都有可能是“潜在的无效票”。自总统大选司法验票以来，除了有争议的选票外，主要发现的问题，包括错用或错置总统选举与公投选举人名册、开票数统计有些微误差，以及选票放错票袋等，出现一些选务疏失但未发现有严重舞弊作票的事情。
台湾总统大选验票工作的许多验票人员由于长时间全神贯注地检查选票，故造成眼睛酸痛、模糊，甚至头痛，加上紧张的气氛，使身体过度紧绷，有些工作人员还有失眠的情况发生。另据台湾一项民调显示，不到10%的民众认为验票会改变选举结果，72.8%不认为验票会改变选举结果；相信司法验票公正性的民众有59%，不相信的有10%。
国民党秘书长林丰正10日晚召开记者会说：冒领、多发选票、灌水的情况比想象中严重；国民党代表律师蔡玉玲指出，验票过程发现的弊端比国亲接到民众检举的还多。按照法律，如果中选会的选务出现重大瑕疵，法院将判决选举无效而重新补选。代表民进党验票的律师顾立雄则在民进党的记者会上表示，从整天的验票看来，他不认为会有多过2万张的争议票，使选举结果翻盘。
验票结果被认为是国民党候选人连战政治生涯的“最后一仗”，他10日到台北县的验票中心向参与工作的律师致意时表示，验票不是为了个人或政党，而是为了台湾的民主法治和公理正义。亲民党主席宋楚瑜说，在野党会据理力争，但不会无理取闹。担任连宋竞选总部主任委员的立法院长王金平表示，验票结果与蓝军是否承认败选没有关联。验票只是第一阶段，随后必须进行选民名册的对比，以及最后阶段的当选无效、选举无效诉讼。
台湾高等法院指出，验票工作只是属于第一阶段的“形式验票”，本次整理出来的争议票，每一张都必须交给高等法院的合议法庭，再由双方律师经过辩论认定，最后才决定验票结果，按照法律，整个过程最迟必须在6个月内结案。台高院合议庭12日傍晚紧急函文传真全台各地方法院，凡是大选票袋全部错放公投票，以及选举人名册错置，必须取出公投票袋，核对是否装有大选选票，和选举人名册，并进行勘验；凡是公投票袋中有部分总统大选选票、部分公投票，则短少的大选选票一律改计无效票。
总统大选司法验票过程中，从台北县市到高屏县市都发现公投票与总统选票错放、公投选举人名册与总统选举人名册错置情况，衍生重大争议。国亲律师因此紧急前往高院递状，申请合议庭裁定，凡是在公投票袋中找到总统选票，应由发现的各地院查扣、封存，然后送交高院合议庭实质调查。由于本届的总统大选首次与公民投票同时举行，验票工作出现不少状况，包括选票失踪、选票数目与选民名册不符、空白选票流失、选票袋封口无端开启等现象。
台湾验票进行到14日，国亲初步统计需送高院认定的争议票已超过3万张，至于选举人名册和选票兜不拢的“幽灵选票”也继续长到接近2万张。验票以来，国亲律师疲于兜拢各种数字。例如，选举人名册缺页不完整，领票数就不完整，选票不见了，领票数和投票数也兜不起来，可能有冒领的问题。在高院判读之前，这些选票都有可能是“潜在的无效票”。自总统大选司法验票以来，除了有争议的选票外，主要发现的问题，包括错用或错置总统选举与公投选举人名册、开票数统计有些微误差，以及选票放错票袋等，出现一些选务疏失但未发现有严重舞弊作票的事情。
台湾总统大选验票工作的许多验票人员由于长时间全神贯注地检查选票，故造成眼睛酸痛、模糊，甚至头痛，加上紧张的气氛，使身体过度紧绷，有些工作人员还有失眠的情况发生。另据台湾一项民调显示，不到10%的民众认为验票会改变选举结果，72.8%不认为验票会改变选举结果；相信司法验票公正性的民众有59%，不相信的有10%。