该案4名受害人中的3位家属提出了刑事附带民事赔偿，共计82万余元。几名受害者的亲属均到庭参加庭审。马加爵的父亲和姐姐到庭旁听。
法庭两侧显示屏上，黑底白字的“ 马加爵故意杀人案”透着压抑气息，庭审现场格外肃穆。96个座位的旁听席座无虚席，数百名来自全国各地的媒体记者无奈被拒在法院大门外。
马加爵只讲了寥寥几句话
马加爵始终没有向旁听席上看一眼，他的父亲马建夫坐在旁听席最后一排，面容乌青憔悴。马加爵没有为自己辩护，轮到他发言时，他的话很少。但寥寥的几句却让人触动。
“很后悔”有律师问马加爵，连杀4人，现在是否感到后悔，马加爵这样说。
“我同意他们的观点，我应该被判极刑。”在刑事辩论部分，受害人代理律师发言后，轮到马加爵为自己辩护，他这样说。
“他们说的我赞成，我应该赔钱，但我没有钱，我没办法。”受害人代理律师提出民事索赔时，马加爵这样说。
“ 我应该道歉，可现在说这些又没有用，我对不起受害人。”受害人代理律师提出要让马加爵公开道歉时，马加爵表态。
“ 我要求被判极刑，我感谢审判员。我的手段太残忍，伤害了那么多家庭，谁都爱自己的儿子，可怜天下父母心。但我伤害最重的还是我家，我对不起我的父母。我进看守所后，从警察那里听说社会上有不少人关心我，我希望所有和我同龄的人吸取我的教训。”
这是庭审结束前，马加爵的总结发言，是他庭审中说的最长的一段话。然后，马加爵被押出去，他走得有点踉跄。
法庭辩论三大焦点
焦点一：马加爵遗留的7处血迹
根据公安部门委托所做的DNA鉴定，发现在317房东墙、南墙以及蚊帐等7处地方留有马加爵自己的血迹。
这是否表明马加爵作案时受过伤？马加爵肯定表示“没有”。被告辩护律师认为，既然被告连在现场曾经受伤的事实都不曾记得，那他很有可能在杀人时精神处于不正常状态。马加爵的血迹究竟是怎么留下的呢？这成了本案的惟一悬念。
焦点二：精神有没有问题
公诉方出具一份由云南省精神疾病司法鉴定委员会提供的有关马加爵的精神鉴定结果，证据表明，马加爵精神正常。
辩护律师对鉴定结论提出质疑，他认为从4月12日至17日5天的鉴定时间过短，不能客观地反映出马加爵的精神状况，而且鉴定内容并没有提到哪怕是一些诸如脑电图、核磁共振等简单的检测方法。
公诉人认为，鉴定结果是客观公正的,没有支持重新鉴定的申请。
焦点三：马加爵算不算自首
马加爵辩护律师认为，马加爵在三亚被发现时，主动告诉警方自己是马加爵，应算自首，给予宽大处理。
公诉人认为，马加爵在交代自己的作案经过之前，警方已经查明他的犯罪事实，并在全国张贴通缉令。这种情况下马加爵被举报落网和自首没有关系。
24日下午，云南省昆明市中级人民法院一审以故意杀人罪判处被告人马加爵死刑，剥夺政治权利终身。