台湾总统陈水扁10月7日暗示副总统人选是吕秀莲後,引发民进党内各派系的强烈反弹，拥吕派和反吕派纷纷表达立场，指出这种不徵询党内意见的行为模式，彻底惹恼了党内派系,并使得党内斗争浮上台面。
支持台北县长苏贞昌的新潮流系反弹最大，总召集人段宜康抛出重话说：“我不相信陈水扁会那堋傻去选吕秀莲。副手人选是党共同的事务，而不是由阿扁个人决定。”该系另一名立委李文忠也激动地说：“除非陈水扁是脑筋坏掉了，否则为何要一再抛出扁吕配的信息。”一向被视为选战幕後操盘手的新潮流系大老、总统府秘书长邱义仁显然也在状况外，面对媒体的询问全都避而不答。
属於陈水扁嫡系的正义连线，也一改先前的低调静默，表达反对吕秀莲的立场。立委郭正亮说：“这次选举最关键的就是台北市和台北县，非常明显，如果是由苏县长来当副手，胜选几率会比较高。”正义连线大老沈富雄也不认同陈水扁“一人决策”的做法:“ 陈水扁应该考虑大家的感受。”
支持吕秀莲的福利国连线表示“副手应是吕秀莲。”属福利国连线的高雄市长谢长廷说:“不管总统推出任何副手人选，大家都应尊重和支持。”谢长廷被视为最有接班人资历，因此也最不希望苏贞昌担任副手。福利国连线总召集人李俊毅说：“总统常常会出其不意，所以似乎民进党已经慢慢习惯这种调调。”民进党秘书长李应元也说：“大家会慢慢喜欢她（吕秀莲）。”
台湾总统副手问题从深一层看，除作为选举课题，还在於陈水扁为自己未来政治发展提前布局。虽然陈水扁目前所操作的一切选举议题，都是从连任的角度出发，他也不能不同时考虑，如何在败选後累积自己东山再起的政治资本。按照现有的游戏规则，如果2004年陈水扁败选，2008年他仍然可以代表民进党参选总统。从这个角度来观察，陈水扁为何及如何操作副手议题，就有了不同的解释。
其次，陈水扁再三强调下任副手无关接班人问题，除了有安抚各派的用心，也间接表露了“卧榻之侧，岂容他人鼾睡？”的考虑。接班人就是要“取扁而代之”，无论自然生命或政治生命，52岁的陈水扁都还有在政坛继续挥洒的本钱。然而，副手议题的效用和总统任期一样受制於时效性，一旦失去了总统的权位，陈水扁“共主”的地位依然会受到挑战。因此，单靠操作副手议题还是不足，要在党内各派虎视眈眈的逆流中泅游，陈水扁必须要有更主动的作为。
支持台北县长苏贞昌的新潮流系反弹最大，总召集人段宜康抛出重话说：“我不相信陈水扁会那堋傻去选吕秀莲。副手人选是党共同的事务，而不是由阿扁个人决定。”该系另一名立委李文忠也激动地说：“除非陈水扁是脑筋坏掉了，否则为何要一再抛出扁吕配的信息。”一向被视为选战幕後操盘手的新潮流系大老、总统府秘书长邱义仁显然也在状况外，面对媒体的询问全都避而不答。
属於陈水扁嫡系的正义连线，也一改先前的低调静默，表达反对吕秀莲的立场。立委郭正亮说：“这次选举最关键的就是台北市和台北县，非常明显，如果是由苏县长来当副手，胜选几率会比较高。”正义连线大老沈富雄也不认同陈水扁“一人决策”的做法:“ 陈水扁应该考虑大家的感受。”
支持吕秀莲的福利国连线表示“副手应是吕秀莲。”属福利国连线的高雄市长谢长廷说:“不管总统推出任何副手人选，大家都应尊重和支持。”谢长廷被视为最有接班人资历，因此也最不希望苏贞昌担任副手。福利国连线总召集人李俊毅说：“总统常常会出其不意，所以似乎民进党已经慢慢习惯这种调调。”民进党秘书长李应元也说：“大家会慢慢喜欢她（吕秀莲）。”
台湾总统副手问题从深一层看，除作为选举课题，还在於陈水扁为自己未来政治发展提前布局。虽然陈水扁目前所操作的一切选举议题，都是从连任的角度出发，他也不能不同时考虑，如何在败选後累积自己东山再起的政治资本。按照现有的游戏规则，如果2004年陈水扁败选，2008年他仍然可以代表民进党参选总统。从这个角度来观察，陈水扁为何及如何操作副手议题，就有了不同的解释。
其次，陈水扁再三强调下任副手无关接班人问题，除了有安抚各派的用心，也间接表露了“卧榻之侧，岂容他人鼾睡？”的考虑。接班人就是要“取扁而代之”，无论自然生命或政治生命，52岁的陈水扁都还有在政坛继续挥洒的本钱。然而，副手议题的效用和总统任期一样受制於时效性，一旦失去了总统的权位，陈水扁“共主”的地位依然会受到挑战。因此，单靠操作副手议题还是不足，要在党内各派虎视眈眈的逆流中泅游，陈水扁必须要有更主动的作为。