台北代表队8月27日正式向主办第四十届国际少年运动会的曼谷市提出书面抗议，对北京代表8月26日抢夺中华民国国旗表达不满。
　　台湾中央社报道，主办单位则决定随后的颁奖典礼，各国选手都不得带国旗领奖，以平息争议。随行台湾行政院体育委员会主任秘书张芬芬8月27日上午与台北市代表团正式向主办单位提出书面抗议。对于主办单位的回应，台方表示可以接受，但对于北京的“蛮横作风”深感到不满。
　　在8月26日的比赛中，台北市选手夺得3金2铜，但在选手披戴中华民国国旗上台领奖时，却被参赛的北京队职员抢下国旗，甚至取走教育局队职员手中的国旗。双方人员还发生了口角。台北市副市长金溥聪8月27日返回台湾，指责中国代表“伤害青少年彼此交谊竞技的运动精神，更突显其蛮横粗暴”。此后，台北市代表团并未受到这起事件的影响，运动员继续在一些项目中取得了好成绩。