关东地区
　　●6月10日，来自日本东京、广岛、北海道等15个地区的40馀名中国留学生代表齐聚东京，认真学习胡锦涛在两院院士大会上的讲话。同日，参与学习讨论会的日本各个地区的留学生代表成立了第１５届全日本中国留学人员友好联谊会，并选举产生了新一届会长、副会长。东京工业大学博士生李光哲再次当选为会长。
　　●6月6日至8日，云南省政府经贸代表团一行人访问日本，6日上午在NPO法人日本云南联谊协会的安排下在目黑五月会馆举行了经济文化座谈会。
　　●长野县伊那市两处逮捕了13名（男性10名、女性3名）非法在留的中国人。他（她）们是被当地居民举报揭发后，被入管局联合警方逮捕的。
　　中部地区
　　●6月5日，静冈县警察逮捕了沼津市在住的两中国人。被逮捕者均是非法在留者，他们是在5月7日用假登录证申请携带电话后，被店员识破而被逮捕的。
　　 关西地区
　　●6月4日，西日本新华侨华人联合会在大阪上海新天地为即将离任的中国驻大阪总领事馆赵大为领事举行欢送宴会。西日本新华侨华人联合会30馀名代表参加了欢送会。
　　中国地区
　　●6月2日、3日，“日中社会学会”第18次大会在岛根县立大学开幕，中、日两国研究者25人参加了会议并发表了研究成果。
　　九州地区
　　●6月10日凌晨4点左右，一艘巴拿马船籍的货船和大分县国东市的渔船相撞。渔船船长70岁的花崎重信当场死亡。巴拿马船籍的货船船长46岁的中国人李林已被警方逮捕。