被日本足坛寄予厚望的J联赛冠军大阪钢巴队1比1战平全北现代队后，他们在亚冠联赛第五比赛日结束后提前出局，与此同时，远赴韩国的上赛季日本杯赛冠军东京日视队则在与蔚山现代的PK中再次负于对手。同一天的两场亚冠小组赛结束后，两支日本代表队同时宣告出局。
这已经是J联赛代表队连续4年在亚冠小组赛中被淘汰，对于这样的结果，一位日本球迷在亚冠论坛上发出叹息，“每一年的世界俱乐部冠军联赛将在日本举行，但是花了大笔金钱的日本人却只能看著其他亚洲球队与世界顶级球队进行交锋。”
2003年改制的首届亚冠联赛上，分在A组的鹿岛鹿角队出征泰国，结果他们在首战2比2战平泰国BEC萨萨那队，接连以3比4和0比1的比分负于上海申花和大田市民，三战仅积1分排名小组最后一名。虽然这一小组中最终出线的球队是泰国的BEC萨萨那队，但是在中日韩三国俱乐部之间的较量中他们却排名最后。
代表日本出战的另一支球队清水鼓动队则与城南一和、大连实德、奥萨苏帕分在同一小组，结果在大连的单循环比赛中，他们首战0比0战平大连实德，次战1比2负于城南一和，虽然在最后一轮比赛中以7比0的比分痛宰泰国弱旅奥萨苏帕，但是三战仅积4分的他们在与中韩球队的较量中还是排名最后。
2004年第二届亚冠联赛上，代表日本出战的是横滨水手和磐田喜悦。结果横滨水手队与城南一和队同时分在了G组，由于同组的另外两支球队实力较弱，出线的争夺实际上就在这两支球队之间进行，结果横滨水手队主场2比1战胜了城南一和队，客场却以0比1负于对手，最终小组没能出线。
磐田喜悦队则与全北现代、上海申花、BEC萨萨那队一起分在了死亡之组E组，结果他们在客场2比1击败全北现代的大好形势下，主场客场2比3负于上海申花、主场2比4负于全北现代，提前一轮被淘汰出局。
2005赛季，在J联赛中成绩稳定的横滨水手、磐田喜悦再一次同时出战亚冠联赛。运气不错的横滨水手与山东鲁能同分在F组，但是主场0比1、客场1比2两战两负的结果让他们输得无话可说。而再次与中韩冠军分在死亡之组的磐田喜悦队则两负水原三星，与中超冠军深圳健力宝队战成1胜1负，同样早早出局。
本赛季日本更换了两名代表出战亚冠联赛，但是被日本球迷广泛看好的大阪钢巴队和已经降入J2联赛的东京日视队同样没有避免小组赛出局的命运。
在近4届亚冠联赛上，共有清水鼓动、鹿岛鹿角、磐田喜悦、横滨水手、大阪钢巴、东京日视6支球队代表J联赛出战亚冠联赛，这6支球队无论是与中韩俱乐部的一对一PK，还是全部球队分在同一小组进行混战，最终被淘汰的都是日本球队。在过去4年的亚冠联赛上，日本俱乐部队对中国俱乐部作战10场，总成绩为3胜1平6负；对韩国俱乐部作战12场，总成绩是2胜1平9负，无论是对阵中国俱乐部还是韩国俱乐部，他们都处于明显的下风。