早稻田大学11月2日宣布，正式取消小保方晴子的博士学位。早稻田大学去年认定小保方晴子的博士论文存在盗用图片等问题，要求其在1年内进行修改，重新提交符合学术规范的论文。但早稻田大学最终认定小保方晴子修改后的论文未能达到审查要求，故正式撤销其博士学位。

小保方晴子曾要求延长论文修改的期限，但被早稻田大学以无法长期搁置问题论文为由所拒绝。小保方晴子2011年毕业于早稻田大学，获得该校博士学位。

小保方晴子2014年初在英国《自然》杂志上发表论文，声称成功培育出了新型“万能细胞”——“STAP细胞”，引起科学界轰动。但很快，重复实验的科研团队指出其论文存在多处疑点。经过严格的调查，日本理化学研究所于2014年4月宣布这篇论文存在“捏造”和“篡改”，并于今年9月宣布确定所谓新型“万能细胞”实际上是来自该所保存的胚胎干细胞。

这一学术造假事件影响深远。小保方晴子本人从日本理化学研究所辞职，事件所涉美国科学家查尔斯•瓦坎蒂也辞去了哈佛附属医院的职务。更为悲剧的是，小保方晴子的导师笹井芳树因此自缢身亡。