政府1月20日宣布，因发现从美国进口的牛肉中疑混有脊柱等疯牛病(BSE)病原体容易聚积的危险部位，目前决定全面停止进口美国产牛肉。
   首相小泉纯一郎当天晚上向记者透露，听取了农林水产相中川昭一关于全面停止进口美国牛肉的报告。小泉说：“保护民众对于食品的安全感是极其重要的。已有报告要求美国认真对待。”负责检疫进口牛肉的厚生劳动省当日决定搁置办理美国产牛肉的进口手续。
   据来自农林水产省动物检疫所成田分所的消息称，疑混有危险部位的牛肉是一家日本商社做为样品空运到日本的，在目视检查时被发现。
   政府于去年12月刚刚决定重新开始进口美国产牛肉，但附加条件是必须除去脑、头部以及脊椎、脊柱、回肠、特定危险部位，并且仅限于出生20个月以内的牛。美国农业部长迈克．约翰斯1月20日对记者表示，农业部派遣的检查人员“认为没有必要去除这些部位”，承认了检查工作存在严重疏漏。而出口问题牛肉的食用肉相关从业人士也作出说明称“我们对出口标准的解释存在误解”。这表明美国官方和民间都违背了日美恢复牛肉贸易时所确定的规则。
   由于消费者对美国产牛肉的不信任感进一步加深，恢复再次遭禁的牛肉贸易可能需要很长一段时间。因政府决定停止进口美国产牛肉，吉野家D&C公司1月21日决定暂缓实施原定于2月中旬恢复出售牛肉盖饭的计划。吉野家原计划用1月进口的美国牛肉做原料，以限定期间以及时段的形式“复活”牛肉盖饭。但由于美国政府承认出口牛肉的检查制度存在问题，吉野家不得不做出延期的决定。牛肉盖饭上市无期，吉野家对此表示“非常遗憾”。
   内阁官房长官安倍晋三1月21日在山口县下关市召开记者招待会时，否认决定于去年12月起恢复进口的政府负有责任。
   安倍强调：“政府是基于美国将遵守出口有关条件这一判断而做出此项决定的，在作决定的阶段并没有错误。”就今后的应对问题，安倍表示：“农林水产省及有关省厅首先将就向美国提出何种要求进行讨论。此次停止进口后何时解禁是今后不得不考虑的问题。”
   自民党干事长武部勤在和歌山县南部町进行的演讲中对美国进行了强烈的批评，称“这是难以原谅的，对于再次发现牛肉中混入了特定危险部位我感到很遗憾，并吸取到了教训。美国人不理解日本人在食品方面细腻的心情，我不得不感到愤慨”。