吉尔吉斯斯坦当选总统巴基耶夫7月11日表示，要求美国重新考虑是否有必要保留在该国的军事基地。有迹象表明，巴基耶夫上台后，将继续奉行亲俄罗斯、远美国的政策。
在经历议会选举风波、前总统阿卡耶夫被迫流亡之后，初步统计结果显示，代行总统职权的总理巴基耶夫在10日的总统选举中获得压倒性胜利，他在已统计的99.52%的选票中获得86.97%的选票，遥遥领先于其它候选人，当选新总统已经没有悬念。包括巴基耶夫在内，共有6名候选人参加了这次总统竞选。
巴基耶夫11日说：“阿富汗已举行总统和国会选举，那里的局势已经稳定。现在我们可能开始讨论美军继续驻留吉尔吉斯的必要性。”他的谈话呼应了上海合作组织此前举行峰会发表的声明，以中俄为首的这个区域安全合作组织呼吁美国及其盟友订下从吉尔吉斯斯坦、乌兹别克斯坦和塔吉克斯坦撤军的日期。
吉尔吉斯的邻国乌兹别克斯坦也对其境内美国军事基地的前途提出问号。美国在“9．11”之后在石油资源丰富的中亚地区建立军事据点的战略，出现逆转的迹象。据美国军方透露，乌兹别克南部的空军基地至少驻扎800名美国士兵，约1200名美国和韩国士兵驻在吉尔吉斯，约200名法国空军人员驻在塔吉克斯坦。“9．11”后，美国以反恐为名，征得吉前总统阿卡耶夫的同意，在吉首都比什凯克建立了军事基地，主要是供空中加油机使用。乌兹别克、吉尔吉斯和塔吉克斯坦可在180天前提出通知，结束美军基地的安排。
巴基耶夫生于1949年，2000年至2002年出任吉尔吉斯斯坦总理，2002年至2005年担任吉议员。2005年3月前总统阿卡耶夫出走后，他被议会选举为总理，代行总统职务。