针对陈水扁家族洗钱案，台特侦组去年九月向瑞士司法当局请求协助的函文中写到，陈水扁及吴淑珍涉嫌收取的不法政治献金是新台币31亿，这与特侦组目前已经起诉的金额有很大差距。国民党立委邱毅质疑，这是不是检察总长陈聪明及特侦组在吃案，隐藏了扁家部分的犯罪证据。

《壹周刊》报道，特侦组曾去函瑞士司法当局，要求协助处理扁家存在瑞士金融机构的不法政治献金，不过在特侦组的函文中，明确表示扁家的不法政治献金有31亿新台币，这和陈致中与检方在认罪协商时，承诺要汇回的12亿中，已经被起诉的部分有很大差距，邱毅质疑，难道是陈聪明在吃案？邱毅也说，就算陈致中承诺的12亿在年底会回台湾，但是其中还是有很大一部分款项没有被起诉，就不全然是犯罪所得，所以还是有很大一笔钱是扁家的。邱毅说，陈聪明不要再压住扁家弊案。